Pourriez-vous préciser votre question ? Enfin, si je l'ai bien compris, il vaut mieux donner un exemple concret : prenons l'espace méditerranéen. Il couvre un domaine vaste, le bassin méditerranéen dans sa grande majorité, plus quelques territoires en Australie et en Amérique. Il n'empêche que, à une échelle très locale, comme le bassin versant d'un petit cours d'eau, on retrouvera ce qui en fait un milieux méditerranéen (au niveau géomorphologique, hydrologique, climatique et biogéographique), avec une saison sèche et chaude en été, et humide et douce en hivers, des pentes fortes, des formations végétales plus ou moins fermées selon l'anthropisation mais avec des espèces récurrentes (chêne vert, pin d'alep par exemple), des crues au printemps et en automne, etc...
Au contraire, c'est parce qu'on retrouve des espaces similaires à une échelle locale qu'on peut définir les grands milieux il me semble !